명절마다 ‘몇등이냐, 취직했냐’ 묻지 말고, 자녀 위해 서울 집을 먼저 생각하세요

안녕하세요, 마켓핑크입니다. 아파트 한 채도 아닌 두 채를 같은 달에 매도한다면, 양도세 신고가 어떻게 달라질지 궁금하지 않으셨나요? 실제로 저도 비슷한 상황을 겪으면서 양도세 신고가 생각보다 까다롭다는 걸 절실히 느꼈답니다. 아마 많은 분들도 같은 달에 다주택을 팔 때 세금 신고 과정에서 어려움을 겪으실 텐데요. 오늘은 그런 분들을 위해 2025년 최신 개정 세법과 국세청 신고 시스템을 꼼꼼히 살펴보면서, ‘아파트 2채 같은 달 매도 시 양도세 신고’의 모든 것을 친절하게 알려드리려고 합니다.
처음에는 그냥 한 채씩 신고하면 되겠지 싶었는데, 현실은 조금 다릅니다. 실제로 저도 올해 5월에 아파트 두 채를 각각 다르게 팔았을 때, 각각 신고서를 내면 나중에 첫 번째 신고서가 자동으로 삭제되는 상황을 겪었어요. 이럴 때 세금 납부 내역은 남아있는데, 신고서 정보가 한 건만 남아 있어 정말 당황스러웠죠. 아마 이런 경험에 공감하실 분들 많으실 겁니다.
국세청의 양도소득세 신고 시스템은 같은 과세기간(보통 한 달 혹은 연 단위) 내 양도한 부동산은 반드시 ‘합산 신고’를 하도록 설계되어 있습니다. 한 건씩 따로 신고할 경우, 마지막 신고서가 이전 신고를 대체하기 때문에 이전 신고 내역은 시스템에서 사라지는 것입니다. 따라서 두 채를 각각 신고하는 게 아니라 두 건 모두를 포함해 하나의 신고서로 합산해 신고해야 합니다.
2025년부터는 부동산 양도소득세 신고 절차와 세율 적용이 일부 변경되었는데요, 특히 다주택자의 양도세 중과 제도와 신고 절차가 강화되었습니다. 기본적으로 같은 달에 두 건 이상의 부동산을 양도할 경우, 양도소득세 신고 시 합산 신고가 의무화되었고, 이에 따른 신고서 작성 시 두 건 모두를 누락 없이 입력해야 합니다.
국세청 홈택스 시스템에서도 명확히 합산 신고를 요구하고 있는데요, 양도소득금액 계산명세서에 각각의 물건을 추가해서 신고해야 하며, 세율 산출도 합산 양도소득에 따라 진행됩니다. 따라서 한 건만 신고서에 입력하고 다른 한 건은 따로 신고하면, 시스템에서 첫 번째 신고서가 삭제되는 문제를 겪게 됩니다.
제가 직접 경험한 사례를 소개할게요. 올해 5월 초에 첫 번째 아파트를 매도하고, 같은 달 말에 두 번째 아파트를 팔았습니다. 처음에는 각각 별도로 신고서를 작성해 신고했는데, 나중에 두 번째 신고서를 제출하고 나니 첫 번째 신고서는 전산상에서 사라진 거예요. 세금 납부 내역에는 금액만 남아 있었고, 신고서에는 두 번째 주택 정보만 있었죠.
이때 세무사님과 상담 후 알게 된 점은, 반드시 같은 달 매도 건은 ‘하나의 신고서’에 합산해 신고해야 하며, 첫 번째 신고서가 삭제되는 건 시스템 특성상 ‘최종 신고서’만 남기기 때문이라는 점이었습니다. 그래서 두 번째 신고서에 첫 번째 주택 정보와 관련 첨부자료를 모두 추가해 재신고를 진행했습니다. 이 과정에서 이미 납부한 세금 내역을 ‘기납부 세액’으로 조정하여 반영하는 것도 매우 중요했습니다.
많은 분들이 ‘한 건씩 따로 신고해도 괜찮겠지’라고 생각하기 쉽지만, 이는 큰 오해입니다. 같은 과세기간에 일어난 모든 양도는 합산 신고가 기본이고, 이를 어기면 신고 누락으로 간주될 수 있어 가산세나 추후 세무조사 대상이 될 수 있습니다.
또한, ‘세금 납부만 하면 신고는 별도로 신경 안 써도 된다’는 생각도 위험합니다. 납부 내역만 확인된다고 해서 신고서가 제대로 제출된 것은 아니고, 신고서 자체가 시스템에 남아있어야 세법상 적법한 신고가 완료된 상태입니다.
양도세 신고는 단순히 세금을 계산해 납부하는 절차가 아닙니다. 신고서 작성 시 모든 양도 건을 정확히 반영하고, 첨부 자료를 꼼꼼히 준비하는 게 무엇보다 중요합니다. 특히 다주택자가 같은 달 여러 주택을 양도할 때는 반드시 합산 신고가 필요하니, 신고서 작성 단계에서 두 건 모두를 포함해 명세서에 등록하는 습관을 들이세요.
또한 기납부 세액이 있을 경우에는 반드시 신고서 내 ‘기신고 조정공제’ 항목에 반영해 중복 납부를 방지해야 합니다. 만약 신고 후 오류를 발견했다면 바로 수정 신고를 진행하는 게 안전합니다. 국세청 홈택스에서 신고 내역 확인과 정정 신고가 가능하니, 신고 후 꼭 확인 과정을 거치세요.
아파트 2채 이상을 같은 달에 매도할 때는 양도세 신고가 까다로울 수밖에 없습니다. 하지만 세법과 시스템 구조를 잘 이해하고, 정확히 합산 신고서를 제출한다면 불필요한 가산세나 세무조사 위험에서 벗어날 수 있습니다. 실제 사례를 통해 보여드린 것처럼, 두 건을 각각 신고하려다 신고서가 삭제되는 오류는 반드시 피해야 할 부분입니다.
2025년 최신 개정 세법도 다주택자의 신고 의무를 더욱 엄격히 하고 있기 때문에, 신고 과정에서 꼼꼼함과 주의는 필수입니다. 여러분도 꼭 신고서 작성 시 양도 건 모두를 합산해 한꺼번에 신고하는 것을 잊지 마시고, 국세청 홈택스에서 신고 내역과 세금 납부 내역을 꼼꼼히 확인해 보시길 권합니다.
Q1. 아파트 2채를 같은 달에 팔면 각각 신고해도 괜찮나요?
아니요, 같은 달에 양도한 부동산은 반드시 하나의 신고서로 합산 신고해야 합니다. 각각 신고할 경우 시스템상 이전 신고서가 삭제될 수 있습니다.
Q2. 이미 한 건 신고하고 세금을 납부했는데, 나중에 다른 건을 신고하면 어떻게 되나요?
두 건 모두 합산한 신고서를 다시 작성해 재신고해야 하며, 이전에 납부한 세금은 ‘기납부 세액’으로 신고서에 반영해 중복 납부를 막아야 합니다.
Q3. 신고서 제출 후 신고 내역이 사라졌다면 어떻게 해야 하나요?
국세청 홈택스에서 신고 내역을 다시 확인하고, 누락된 양도 건을 포함해 신고서를 수정해 재신고하는 것이 좋습니다.
Q4. 합산 신고 시 참고할 만한 최신 세법은 어디서 확인할 수 있나요?
국세청 공식 홈페이지와 2025년 세법 개정 내용을 참고하면 정확한 정보를 얻을 수 있습니다. 특히 양도소득세 관련 공지사항을 주기적으로 확인하세요.
마지막으로, 양도세 신고는 복잡하지만 꼼꼼함과 정확한 이해가 최선의 방책입니다. ‘마켓핑크’가 알려드린 이 가이드가 여러분의 세금 신고에 조금이나마 도움이 되길 바랍니다.
감사합니다!